高校建HPC：理清应用是关键

去年8月的ChinaGrid大会上，服务器在线曾见到过两位英特尔服务于高校和HPC的专家：英特尔（中国）有限公司亚太客户响应团队技术经理何万青博士、英特尔（中国）有限公司企业解决方案部教育行业中国大区经理姜涛先生，当时，何万青博士提到他的一项重要工作就是：“帮助高校客户理清他们的应用特点，即针对他们的HPC应用进行特性分析。”而这，也是高校建HPC的关键。像在魏晓辉的高性能计算中心里，就不仅仅有瘦节点的架构，还有胖节点的HPC。

正是各个应用的不同，才导致了各个院系之间对HPC需求的不同，当然，题外话，核心的话题是，不应用所体现出来的特性不一样，有的是内存敏感型，有的是主步敏感，有的是I/O敏感，所以，建设HPC要从几个重点，如处理器、内存、IO、网络负载等方面去着眼，经过大量的应用程序分析，确定HPC中心常用的应用程序的负载类型，然后才总结出其应用的特性，最终进行正确的设备选型??像气象研究就是缓存和内存敏感的应用程序偏多，处理器主频并非核心影响因素，像魏晓辉测试至强5600的VASP就是内存敏感型，在英特尔的测试中，最大内存使用达到1GB，每个核心的内存通道带宽需要3.2GB/s，而分子模拟方面的Amber10程序则只需0.2GB/s的内存带宽，类似的还有GROMACS和DACAPO。

在这方面，英特尔是走在前沿的，在至强5600发布会后的采访中，英特尔解决方案部中国大区技术部经理梁岩先生就表示，“将来国内的大部分高性能计算除了强调科研成果的同时一定要考虑商业运作的支撑能力和支付能力，一个是应用的实际效果，一个是成本和产出比考虑，是整个系统综合的效能是一个关键因素。”因此，英特尔会和合作伙伴、OEM、最终用户会持续关注应用的特征模型，帮助他们找出中间关键性能的点，从CPU、主板、I/O的吞吐能力整个系统的协调能力和软件优化层面多方位和客户一起合作。梁岩说，这项工作是英特尔从去年一直到今年，再到未来都会去做的事情，大家会“在一些项目里会陆续看到一些最终优化完的实际效果的展示案例出来。”

而在魏晓辉建立新HPC中心的招投标过程中，英特尔和其OEM合作伙伴，在这方面做的显然要比竞争对手好得多，这从魏晓辉的回答中已经能够得到答案。不过，魏晓辉也毫不掩饰的表示，选择最后的供应商和英特尔平台，“很简单就是性价比决定的”。